人类的过半数都居住在宇宙，生儿育女，已经将近一个世纪了。但是，因为有着以那丰润的身影漂浮在宇宙中的地球，而使得人类仍然容许某些贪图安逸的人存在。在这当中，有着两个男人，曾经分为敌我双方而战斗，而后、又成为友军并肩作战。他们是因为一位女性而纠葛在一起的二个男人。时过境迁，这二个男人，各自在自己的意志的驱策之下，栖居在宇宙中。而他们即将有第三次的相逢，不过那并非是命运在如此地引导着他们，而是因为他们的意志都朝着这种结果在运作着。但是，那也并不是事先所预定的事。因为在二人的思想之中都具有着在不断变化的事态当中，逐渐地对应各种新局面的那种柔软性，所以才会如此。若是只拘泥于一点，只被某一种思想所束缚，就似乎要窒息的那种恐惧，导致他们具有了这样的习性吧。但是，人是只拥有一副肉体的生物。蓄积在身体深处的记忆，和所谓的感情交杂在一起，而一直束缚着现在的他们。所以，对于转变抱持着憧憬的他们，才会有着想要相互刺激的欲望。如果，他们能够在彼此之外找到可以相互刺激的其他人，那么他们二人应该也就不会如此地对峙了。但是，很不幸的，他们在自己的周围，并无法找到更崭新的新人类…U.C.0093年，新基奥军的总帅夏亚·阿兹纳布尔，再度挑起与地球联邦政府之间的战争。陷入窘地的联邦军，让隶属奥古的阿姆罗·雷和布拉德·诺亚组建独立部队朗德·贝尔舰队。高呼“将人类从地球的束缚中解放出来”的夏亚，欲将小行星阿克西斯坠落地球。阿姆罗驾驶新高达，与其宿敌夏亚做最后的生死斗。出这部剧场版的时候，正值gundam系列20周年的最顶峰！是一部设定非常好的高达系列动画！